Церковь Иоанна Кронштадтского – одна из немногих деревянных церквей в Белгороде. Первый закладной камень храма был освящен в 2008 году, а сам храм был построен к 2009 году. Гостями на церемонии освящения были ветераны военно-морского флота, так как Иоанн Кронштадский является покровителем всех моряков.
Икона, находящаяся в храме, была освящена в Иоанновском женском монастыре Санкт-Петербурга. Передана в дар храму она была губернатором Белгородской области Евгением Савченко.