Начиная с 1988 года, в галерее было осуществлено около 300 арт-проектов, причем многие из них в содружестве с крупнейшими музеями России – Государственным музеем изобразительных искусств имени А. С. Пушкина и Государственной Третьяковской галереей.
«Ковчег» также сотрудничает с другими московскими и региональными музеями, наследниками художников и коллекционерами. Галерея участвовала в программах Московских международных биеннале современного искусства.
